研究生教育是我校学历教育的最高层次， 2004年，我校人体解剖与组织胚胎学、中药学、肿瘤学三个专业招收研究生14人，2007年又增加了病理学与病理生理学、病原生物学两个专业共五个专业招收研究生33人，2010年我校硕士一级学科申报取得突破，临床医学和基础医学两个一级学科2011年3月3日通过了国务院学位委员会的批准，我校硕士学位授权二级学科由原来的5个增加到26个。中药学“专业学位”授予权获得批准，成为我校首批开展专业学位教育的专业。2012年我校研究生招生133人，首次突破3位数，　在校生将达到283人。这对我校研究生教育的发展具有里程碑意义，我校研究生教育正走上快速、协调发展的道路。